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1、反对者称这对转基因食物进行的安全性研究都是短期的，无法有效评估人类几十年进食转基因食物的风险。
2、另外的反对者则担心转基因生物不是自然界原有的品种，对于地球生态系统来说是外来生物。
3、转基因生物的种植会导致这种外来品种的基因传播到传统生物中，并导致传统生物的基因污染。
4、许多环境保护组织，包括绿色和平、世界自然基金会和地球之友等国际机构都持有该种观点。
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